大东亚分部 (GEA)
如今改制为分部的首个分部，以中国为首，Bane Aloe主任负责。这一分支包括东亚的大部分国家，包括蒙古和阿塞拜疆的一小部分。目前，该分支专注于东亚神话文物和生物的研究和调查，以及2014年温州UFO坠毁事件。
西欧和英国分部 (WEB)
第二分部，由Chey主任领导。这一分支包括不列颠群岛，苏格兰、法国、西班牙、葡萄牙等国。他们目前从事军事技术和硬件上研制超自然武器。
南亚和大洋洲分部 (SAO)
第三分部，由Ran主任负责。这一分支机构覆盖了东盟大部分国家、印度、印度尼西亚、澳大利亚和菲律宾。该分支与GEA合作，研究东亚和大洋洲本土民间传说中的异常物件和生物。他们目前掌管着Pacifica海军研究设施，这里收容有至少80种生物和物件。
西拉丁美洲分部 (WLA)
第四分部，由Onn主任领导。这个分支覆盖南美洲的西部，邻近岛屿和墨西哥南部。他们目前利用墨西哥和哥伦比亚贩毒集团进行经济流通和武器收集。
俄罗斯分部 (MB)
第五个，也是最新一个将并入新格鲁乌的分支机构，位于俄罗斯。它由Alexandra Emiliya Ilyinishna主任负责业务监督，迄今证明在恢复部门功能方面卓有成效。
部门仍在寻找更多丢失的分支。下面是尚未识别或未被发现的分支列表。
格陵兰分部 (GB)
位于格陵兰岛秘密分支，最后一位主管是[UNKNOWN]。
丝绸之路国家分部 (SRC)
包含丝绸之路上大部分国家的分部，包括土耳其、希腊、塞浦路斯。最后的主管是Los。
密克罗尼西亚专家团 (MSB)
密克罗尼西亚长期以来一直是超自然活动的热点，尤其是神秘学性质的异常。MSB的职能是保护这些异常并研究它们。
一些未被发现的分部分支已经开始了自己的转型。下面是一些令人憎恶的分部和分支的列表。
阿列夫分支（Aleph Dividend）
由三个流氓分支组成的敌对集团。目前，只有前捷克斯洛伐克分部被确定为该组织的一部分。他们曾经拥有四（4）THURA级别的异常，但情报部门发现这些异常已经流失到了一个尚未确定的敌对组织。异常的流失让其已沦为佣兵团体，走向了利用过时武器服务当地军阀的道路。
扎克分支（Zafkiel Subtrahend）
前部门特种部队，驻扎在百慕大三角的某处。这个流氓集团是由前侦查、快速反应和渗透人员组成的精英集团领导的。该小组拥有三（3）Kleidaria级别的文物，它们都能够造成世界性的超级事件。自他们脱离控制以来，该小组的活动很少，但部门应继续密切监测其动向。